A estrutura curricular do PEC, como os demais cursos de pós-graduação da UFC, é composta por disciplinas e atividades. A carga horária das disciplinas é expressa em créditos (cr), correspondentes ao número de horas de aula semanais. Na UFC, cada período letivo corresponde a 16 semanas, assim cada crédito corresponde a 16 horas-aula (1 cr = 16 h).

Atualmente, o Programa oferece pelo pelo menos 4 disciplinas por semestre por área de concentração. As disciplinas visam fornecer aos alunos uma formação ampla e sólida na sua área de concentração, além dos conhecimentos específicos necessários ao desenvolvimento de sua dissertação. A grande maioria das disciplinas são de 3 créditos (48h).

Além das disciplinas, os alunos de cada área devem realizar 5 atividades obrigatórias que contam créditos (cr) como: Seminário (1 cr),  Proficiência em língua estrangeira (1 cr), Qualificação (1 cr), Estágio de Docência I (4 cr) e Dissertação (6 cr). A atividade de Qualificação visa avaliar os conhecimentos do aluno no seu tema de dissertação, bem como a relevância e viabilidade da sua proposta de dissertação.

Os alunos devem idealmente concluir os 24 créditos obrigatórios referentes às disciplinas nos dois primeiros semestres. Nesse período, o aluno deve cumprir também a atividade Seminário. As atividades de Qualificação e Proficiência devem ser concluídas até o terceiro semestre, pois são requisitos para a matrícula em Dissertação que deve ser feita no quarto semestre. A atividade de Estágio de Docência I pode ser realizada no terceiro ou quarto semestre, a critério do orientador e do aluno. Mais detalhes podem ser encontrados no Regimento Interno.